未经过发酵腐熟肥料含有病菌和害虫，直接使用会传播病虫害，滋生细菌。
在土壤内发酵所产生的热量会导致作物根系受损，还会消耗土壤中的氧气，导致土壤缺氧，作物生长受到抑制。
未经过发酵腐熟肥料多为有机态，不会呗作物直接吸收，因此肥效差。
一、未发酵腐熟的肥料有何弊端
1、未经过发酵腐熟肥料多为家禽和家畜粪便，其中含有多种病菌和害虫，直接使用会导致病虫害的传播、作物发病，未腐熟肥料在泥土中发酵时，容易滋生病菌与虫害，也导致植物病虫害的发生。
2、未经过发酵腐熟肥料施入土中进行发酵，发酵产生的热量会影响作物生长，严重时导致植株死亡。
3、未经过发酵腐熟肥料在分解进程中产生甲烷、氨等有害气体，使泥土和作物产生酸害和根系损害。
4、未经过发酵腐熟肥料在分解进程中耗费土壤中的氧气，使土壤暂时性的处于缺氧情况，会使作物生长受到抑制。
5、未经过发酵腐熟肥料多为有机态或缓效态，不可被作物直接吸收利用，所以未发酵肥料直接施用时使肥效减慢。
二、怎么分辨肥料是否腐熟
1、外观法
腐熟的肥料外观应呈褐色或者黑色，且有堆肥发酵特有的气味。另外，已腐熟完全的肥料含水率较低，用力抓时应不粘手。
2、自然封袋法
在自封袋内装入50%-70%的肥料成品，挤掉空气密封，在室温下放置1个月左右，若袋子未膨胀，则表明肥料已完全腐熟。
3、蚯蚓法
在不透明的杯中装入约1/3的堆肥产品，调节含水率为60%，同时使用黑布遮光，置于室温下观察蚯蚓的行为。若蚯蚓立刻钻进有机肥料中，且1天后无任何变化，说明堆肥已完全腐熟。
