科属：牵牛花为旋花科、牵牛属一年生草本花卉植物，而矮牵牛为茄科、碧冬茄属多年生草本植物。
外形：牵牛花叶片宽卵形或近圆形，花冠呈漏斗状，而矮牵牛叶片为椭圆形或卵圆形，花冠呈喇叭状。
习性：牵牛花喜温暖、喜湿、喜光、耐干旱盐碱，矮牵牛喜温暖、喜光、不耐霜冻、怕涝。
花色：牵牛花常见花色为白、红、粉红、蓝、紫，矮牵牛常见花色为紫红、鲜红、桃红、纯白。
一、科属区别
1、牵牛花：牵牛花为植物界、被子植物门、双子叶植物纲、菊亚纲、茄目、旋花科、旋花亚科、番薯族、牵牛属一年生蔓性缠绕草本花卉。
2、矮牵牛：矮牵牛为植物界、被子植物门、双子叶植物纲、合瓣花亚纲、管花目、茄亚目、茄科、夜香树族、碧冬茄属多年生草本植物。
二、外形区别
1、牵牛花：牵牛花茎上被倒向的短柔毛及杂有倒向或开展的长硬毛，叶宽卵形或近圆形，中裂片长圆形或卵圆形，叶面或疏或密被微硬的柔毛。花腋生，单一或一般2朵着生于花序梗顶，花序梗长短不一。花冠漏斗状，蓝紫色或紫红色，花冠管色淡。蒴果近球形，种子卵状三棱形，长约6毫米，黑褐色或米黄色，被褐色短绒毛。
2、矮牵牛：矮牵牛株高15～80厘米，也有丛生和匍匐类型，叶椭圆或卵圆形，播种后当年可开花，花期长达数月，花冠喇叭状，花形有单瓣、重瓣、瓣缘皱褶或呈不规则锯齿等，花色有红、白、粉、紫及各种带斑点、网纹、条纹等，种子极小，千粒重约0.1克。
三、习性区别
1、牵牛花：牵牛花是一种生性非常强的花，生活环境以温和湿润、具充足阳光照射、通风良好为宜，而且牵牛花对土壤的适应性也很强，较耐干旱盐碱，不怕高温酷暑，属深根性植物，地栽土壤宜深厚。
2、矮牵牛：矮牵牛喜温暖和阳光充足的环境，不耐霜冻，怕雨涝，生长适温为13～18℃，冬季温度在4～10℃，如低于4℃植株生长停止，夏季能耐35℃以上的高温，宜用疏松肥沃和排水良好的砂壤土。矮牵牛属长日照植物，生长期要求阳光充足，在正常的光照条件下，从播种至开花约需100天左右。
四、花色区别
1、牵牛花：牵牛花花色鲜艳美丽，常见的花色有白、红、粉红、蓝、紫等，颜色与遗传基因有关。同时，牵牛花常常会改变颜色，紫色的牵牛花有时会变成兰色，有时会变成红色，变色是一种基因导致细胞液泡酸碱度变化引起的。
2、矮牵牛：矮牵牛花大而多，开花繁盛，花期长，色彩丰富，气候适宜或温室栽培可四季开花，花色有紫红、鲜红、桃红、纯白、肉色及多种带条纹品种（红底白条纹、淡蓝底红脉纹、桃红底白斑条等），通常不会变色。
