播种前，使用60℃热水浸种消毒，然后用清水浸泡几个小时，再用10%磷酸三钠溶液浸种25分钟，沥干后播种。
做好蚜虫防治工作，能够有效阻止病毒病大面积传播。
可在临近发病高峰期或发病初期时，使用2%菌克毒克水剂+叶绿壮浓缩叶面肥兑水后进行防治，或者是使用1.5%植病灵II号乳剂、20%病毒A可湿性粉剂进行防治，每隔7-10天用药一次，连续用3次。
一、怎么防治南瓜病毒病
1、病毒种类
（1）主要感染病毒是花瓜花叶病毒、甜瓜花叶病毒、烟草环斑病毒。
（2）病毒可在低温下潜伏，且在24-28℃都能潜伏。病毒在30℃以上才会呈现症状，蚜虫是诱发这个病害的主要原因，蚜虫飞行吸食带毒其他植物，又传播给南瓜。
（3）病毒可以在蚜虫体内存活一段时间。高温干旱，蚜虫盛发，病害较重，春秋是主要发病季节。
2、感染症状
（1）花叶型：叶片出现黄绿相间斑驳，叶皱缩变小叶边卷曲，主要果实出现，绿色深浅不一的花斑。
（2）蕨叶型：顶端新叶成蕨叶状，像鸡爪一样果实膨大不正常，有颜色不一的班，还会凹凸不平。
（3）皱叶型：在成株后发病，发病叶色浓绿，斑驳，皱缩叶边缘不可展开，感病部位隆起。
3、防治方式
（1）消毒
①播种前要有55℃到60℃之间热水搅拌浸种，消毒，之后要用清水浸种几个小时，再用10%磷酸三钠溶液浸种25分钟，最后捞出沥干后播种。
②在田间劳作时，要注意，不要接触病株后又接触健康植株，要清洗消毒双手和工具，比如锄地，有时会接触到根，伤到一点根系就能造成病毒传播。
（2）用药
①一开始发病时，就要及时防治，使用2%菌克毒克水剂200～250倍液添加叶绿壮浓缩叶面肥3000～4000倍液一起使用，效果最好，通常都是抑制剂加上生长肥一起使用，效果比较好。
②一般用药不要一直使用单一药物，还可以选择1.5%植病灵II号乳剂1000倍液或者20%病毒A可湿性粉剂500倍液。每次用药间隔一周到10天左右，可以根据病情提前一点，连续用药3次左右比较安全。
③目前病毒病都没有比较好的治疗消灭药剂，都是抑制剂，所以预防为主，预防非常重要，预防是主要的病毒控制感染的路径。如果感染使用机制使用抑制剂至少可以有效的避免病毒蔓延。
二、防治南瓜猝倒病的方法
1、发病症状
（1）猝倒病的病原为瓜果腐霉，属卵菌。
（2）从地上部可见幼苗露出土表的根部或茎基部染病后呈水渍状，后变灰褐色，干枯时缢缩为线状，该病扩展速度快，往往子叶尚未凋萎，幼苗已经猝倒。
（3）此外南瓜出土前染病胚轴、幼茎及子叶在土中就已变褐腐烂。湿度大时，病部或病株附近长出棉絮状白色菌丝，且发病迅速，别于立枯病。
2、防治方法
（1）床土应选用无病新土，如用旧园土，有带菌可能，应进行苗床土壤。
（2）加强苗床管理，选择地势高、地下水位低的地做苗床，播前一次灌足底水，出苗后尽可能不浇水，必须浇水时一定选择晴天喷洒不宜大水漫灌。
（3）育苗畦（床）及时放风、降湿，即使阴天也要适时适量放风排湿，严防瓜苗徒长染病。
（4）果实发病重的地区，要采用高畦，防治雨后积水，定植后，前期宜少浇水，多中耕，注意及时插架，以减轻发病。
